En 1781, Chobei Takeda ouvre une échoppe qui commercialise des plantes médicinales et des remèdes traditionnels à Osaka, au Japon : c’est l'origine Takeda. Son activité se développe et l’entreprise, originellement familiale, grandit : Chobei Takeda IV se tourne vers la médecine occidentale. En 1895, ses successeurs font construire la première usine chimique à Osaka et commencent l’importation de composants en provenance d'Angleterre, des États-Unis, d'Allemagne et d'Espagne. Takeda devient un fabricant de produits pharmaceutiques puis s'engage, à partir de 1914, dans des activités de recherche. Dès 1925, l’entreprise se modernise en intégrant des activités de R&D, de fabrication et de commercialisation de médicaments.
L’internationalisation de Takeda date du milieu du XXe siècle. D'abord dans le sud-est asiatique, puis en Europe. En 1978, c'est par la France que Takeda débute son développement européen avant de s'étendre en Allemagne, au Royaume-Uni, en Irlande, en Italie, en Suisse et en Autriche.
En 1998, Takeda Pharmaceuticals North America est créée, cette entité se nomme aujourd’hui Takeda Pharmaceuticals U.S.A.
En 2005, Première expansion du programme de recherche de Takeda en dehors du Japon grâce à l’intégration à la R&D du groupe Syrrx, une société de biotechnologie américaine.
En 2007, Paradigm Therapeutics et sa filiale à Singapour sont également intégrés à Takeda.
En 2008, Takeda acquiert le groupe biopharmaceutique américain Millennium Pharmaceuticals, un rachat important qui contribue à développer notablement le portefeuille de R&D de Takeda en oncologie.
Puis, l’acquisition d’IDM Pharma en 2009 suivra, notamment pour se doter de nouvelles capacités en immunothérapie anti-cancéreuse.
En 2011, Takeda acquiert la société suisse Nycomed, qui permet au groupe de se renforcer en Europe et dans les pays émergents. Takeda achète également Intellikine en 2011, puis en 2012, URL Pharma, Mutilab, Ligocyte et Envoy Therapeutics.
En 2013, Acquisition et intégration de la société Inviragen Inc. (basée dans le Colorado aux U.S.A.), qui permet au Groupe de se renforcer sur le marché des vaccins.
En 2015, Takeda conclut un partenariat avec T-Cira pour le dévelopment de la médecine régénérative.
En 2016, Takeda recentre ses activités de R&D et transfère les médicaments dont le brevet arrive à expiration à la joint-venture Takeda-Teva.
Takeda lance également un programme pour améliorer l’accès aux soins et aux traitements des patients dans les quartiers mal desservis ainsi qu’un programme mondial de RSE pour contribuer à l’amélioration de la santé des personnes, par la prévention des maladies.
En 2017, Acquisition de Ariad Pharmaceuticals renforçant ainsi le portefeuille de medicaments en oncologie.
En 2018, le Shonan Health Innovation Park (Shonan iPark) a été inauguré en tant que le premier éco-système de recherche sur la santé associant recherche publique et privée au Japon.
S’en suit l’ouverture du siège mondial de Takeda à Nihonbashi (Tokyo), bâtiment conçu pour soutenir divers styles de travail et créant un environnement de travail diversifié et moderne.
Puis, Takeda est enregistré au New York Stock Exhange et devient la première et seule entreprise listée à la fois aux bourses de Tokyo et de New York.
En 2019, Acquisition de SHIRE permettant de devenir leader dans les maladies rares et d’étendre la présence de Takeda dans plus de 80 pays.
Ainsi que le lancement de Takeda Initiative 2 pour améliorer la santé maternelle et infantile en intégrant des services de qualité en matière de VIH, de tuberculose et de paludisme en Afrique.